Вологість повітря - це один з головних параметрів мікроклімату будь-яких приміщень, і тому вкрай важливо контролювати її оптимальний рівень. Для інкубації яєць цей показник ще більш значущий, ніж для чого-небудь ще. Адже саме від цього умови залежить повноцінний розвиток майбутніх пташенят.

Особливу роль рівень вологості в інкубаторі грає при виведенні молодняка водоплавних птахів, тоді як для сухопутних - курей, індиків та інших, цей показник не є принциповим. Вологість в інкубаторі забезпечується за допомогою випаровування води. Оптимальний показник відносної вологості повітря для періоду інкубації становить 50-60% і 85-90% для виведення. Висока вологість перешкоджає випаровуванню води з яйця, і відповідно низька - активує даний процес.

Низький показник вологості призводить до того, що волога з яйця починає інтенсивно випаровуватися. Даний процес може вкрай негативно позначитися на розвитку зародка, і з часом привести до «водного голодування ембріона». Такий стан характеризується зниженим надходженням з білка в жовток води і присутніх в ній поживних речовин. Тому забезпечити відповідний рівень вологості вкрай важливо, зокрема на початковому етапі інкубації.

Висока вологість всередині інкубатора не настільки принципова, коли у ембріона вже розвинений аллантоіс і сформована кровоносна система. Ближче до кінця інкубаційного періоду низька вологість гальмує процес тепловіддачі, тоді яйцеві та ембріональні оболонки висихають набагато швидше. При таких умовах у багатьох пташенят ускладнюється процес наклёва, а у вилупилися - склеюється пух, до тіла пристають залишки подскорлупной оболонки і самої шкаралупи.

Надто висока вологість в процесі інкубації робить досить значний вплив на наклев пташенят. При недостатньому витраті рідини відбувається заковтування амниона зародком в великому обсязі. В результаті недостатнього випаровування води алантоїса до фіналу інкубації в оболонках ембріона залишається значна кількість вологи. Через це наклёв відбувається, але висновок показує погані результати.